موزه واتیکان در داخل شهر واتیکان واقع شده اند. آثار به نمایش در آمده در این موزه ها اثر پاپ ها و در طول قرن ها ساخته شده اند. از این آثار می توان به برخی مجسمه های کلاسیک اشاره کرد که مشهورترین و مهم ترین شاهکارهای هنر رنسانس در جهان است.

پاپ ژولیوس دوم این موزه ها را اوایل قرن 16 بنا نهاد. کلیسای سیستین( Sistine Chapel ) نیز که میکلانژ( Michelangelo)  و استانز دی رافائلو (  (Stanze di Raffaelloسقف آن را تزئین کرده اند در مسیر بازدید کنندگان موزه های واتیکان قرار دارد.  سال 2013، 6 میلیون نفر از این موزه ها بازدید کردند و این موزه ششمین موزه پر بازدید جهان شد.

این موزه با  54 گالری یکی از بزرگترین موزه های جهان است.

گالری هنر در آپارتمان بورجیا، موزه مجسمه سازی، موزه پیو کلمنتینو(Pio-Clementino)، موزه( The Prima Porta Augustus)، گالری صلیب یونانی، گالری سالا رتندا (Sala Rotonda)، گالری باستس(Galleria dei Bust)، محفظه ماسک ها، خانه موسیقی سالا دله (Sala delle Muse)، موزه پاپ گرگوری(Gregoriano Etrusco) و موزه ( Gregoriano Egiziano )از جمله موزه ها و بخش های دیدنی موزه های واتیکان هستند.

موزه تاریخی واتیکان نیز مجموعه منحضر به فردی از پرتره پاپ ها از قرن شانزدهم تا به امروز است.