موزه منطقه ای جنوب شرق بستری برای معرفی منطقه جنوب شرق ایران در بخشهای باستان شناسی، مردم شناسی و زیست محیطی است. این موزه در شهرستان زاهدان و در تقاطع خیابان مطهری و خیابان امداد با ۱۵۰۰۰ مترمربع مساحت، دارای ۱۱۰۰۰ مترمربع زیر بنا است که در ۵ طبقه ساخته شده است.
در بخش باستان شناسی اطلاعاتی شامل مشخصات سایت و محوطه باستانی شهر سوخته، کوه خواجه، دهانه غلامان، اسپیدژ، جیرفت، و سایر آثار باستانی، تاریخی منطقه جنوب شرق جهت بازدید علاقمندان جمع آوری گردیده است. از جمله اشیاء به نمایش درآمده آثار حاصل از کاوشهای باستان شناسی در محوطه های باستانی منطقه مثل سفالینه ها، اشیاء فلزی، گلی، سنگی، شیشه، تابلوهای نفیس و کتب خطی می باشد. یکی دیگر از قسمتهای مهم موزه، کتابخانه ی موزه با 5000 جلد کتاب (شامل کتابهای تخصصی با موضوعات میراث فرهنگی، صنایع دستی و گردشگری است.
در بخش مردم شناسی این موزه، ادبیات شفاهی، مشاهیر، فرهنگ و آداب و رسوم، پوشش محلی، خوراک و صنایع دستی معرفی می گردد.
در بخش همکف، بوم شناسی سیستان و بلوچستان و منطقه جنوب شرق کشور معرفی می گردد به همین منظور ویترین هایی برای نمایش گونه های حیوانی و گیاهی منطقه در کنار آکواریوم (آبزیان آب شور) استان تعبیه شده است. ورودی اصلی موزه تابلو، تصویر آثار شاخص تاریخی، فرهنگی، جاذبه های طبیعی و مردم شناسی منطقه به نمایش گذاشته شده است.