کلیسای سیستین، کلیسای کوچکی در قصر پاپ (محل اقامت رسمی پاپ) در شهر واتیکان است. در اصل به عنوان (Cappella Magna ) شناخته شده است. این کلیسای کوچک نام خود را از سیکتوس چهارم( Pope Sixtus IV) گرفته و بین سال های 1477 و 1480 ساخته شده است.

فضای داخلی ساختمان مستطیل شکل کلیسا به ترتیب 40.9 متر (134 فوت) طول و 13.4 متر (44 فوت) عرض دارد. بازسازی ظاهر کلیسا سال 1480 یعنی قبل از نقاشی سقف انجام شد.

 این کلیسا از زمانی که مرمت شد به عنوان محل فعالیت های مذهبی و ماموریتی پاپ استفاده شده می شود و در حال حاضر محل برگزاری انجمن های محرمانه است که در فرآیند آن پاپ جدید انتخاب می شود. بیشترین شهرت کلیسای سیستین به دلیل نقاشی های دیواری و تزئینات فضای داخلی این کلیسا است. میکلانژ سال 1508،  "روز رستاخیز" را به زیبایی بر سقف این کلیسا تصویر کرده است.

پیدا کردن حضرت موسی، محاکمه موسی، ترک مصر و عبور از دریای سرخ، فرود از کوه سینا، مجازات شورشیان، عهد و مرگ موسی از جمله نقاشی های دیواری است که به زندگی حضرت موسی .ع. اختصاص دارد .

دیوار شمالی  ساختمان به داستان حضرت عیسی اختصاص دارد که قدمت آن به سال های 1481-1482 بر می گردد. غسل تعمید مسیح، وسوسه مسیح، رسالت رسولان، خطبه در کوه، تحویل کلید و شام آخر بر این دیوار نقش بسته اند.

رستاخیز مسیح، مناظره بر بدن موسی و نقاشی های دیواری میکل آنژ نیز بر دیواره شرقی ساختمان نقش بسته اند.

میکل آنژ در نقاشی هایش از رنگ های روشن استفاده کرده است که  به راحتی از کف قابل مشاهده است. وی در پایین ترین بخش سقف اجداد مسیح و در بالاترین بخش، داستان آفرینش انسان را نقاشی کرده است. او در ابتدا راه اندازی شد به رنگ تنها 12 آمار و ارقام، رسولان است. وی از کمیسیون چرا که او خود را به عنوان یک مجسمه ساز، نه یک نقاش دیدم. پاپ ارائه شده به اجازه می دهد میکل آنژ به رنگ صحنه های کتاب مقدس به انتخاب خود به عنوان یک مصالحه. پس از کار به پایان رسیده بود بود، وجود دارد بیش از 300. چهره او آفرینش را نشان داد، آدم و حوا در باغ عدن، و سیل بزرگ.

طول و عرض محدوده ای که میکلانژ نقاشی کرده  حدود 40 متر (131 فوت) در  13 متر (43 فوت) است. این به این معنی است که میکل آنژ بیش از 5000 فوت مربع (460 M2) از نقاشی های دیواری را بخوبی نقاشی کرده است.

نقاشی های میکلانژ عکس العمل های متفاوتی را به دنبال داشت. آخرین حکمی که بر علیه او صادر شده وی را به بی اخلاقی و ابتذال متهم می کند و دلیل این ادعا را چهره های برهنه ای که تصویر کرده است می داند لذا کمپینی برای حذف نقاشی ها تشکیل شد.

عکس العمل ها به نقاشی های میکل آنژ باعث شد که دستگاه تناسلی در نقاشی های ابرنگی بعدی که  دانیل دا ولترا(Daniele da Volterra)کشید پوشیده شود.

مرمت این کلیسا نیز به دلیل ترمیم نقاشی های سقفی میکلانژ جنجال آفرید. ترمیم سقف کلیسای سیستین 7 نوامبر سال 1984 آغاز شد و پس از  بازسازی کامل، این کلیسای کوچک در 8 آوریل 1994 بر روی عموم مردم گشوده شد.